Центральный научно-исследовательский институт осетрового хозяйства (ЦНИОРХ) был основан в Астрахани 23 мая 1964 года. Институт стал центром координации всех исследований осетровых в стране. Сотрудники ЦНИОРХ определили биологические основы воспроизводства осетровых в зарегулированной Волге, разработали Правила рыболовства в Волжско-Каспийском бассейне, составили Атлас нерестилищ осетровых Нижней Волги. Эти и другие методики и исследования до сих пор используют в своей работе сотрудники нынешнего КаспНИРХ
В конце 1970-х появилось мнение о нецелесообразности двух институтов одного профиля в бассейне, о необходимости единого подхода к изучению биоресурсов Каспия, разработки единой стратегии. Итогом стало объединение ЦНИОРХ с КаспНИРХ в 1988 году. Несмотря на короткую историю этого института, он сыграл важную роль в развитии направления в целом: вокруг него удалось сосредоточить усилия ведущих учёных и практиков страны и проводить успешную координацию исследований осетровых.
Сегодня «КаспНИРХ» – Волжско-Каспийский филиал ФГБНУ «ВНИРО». В мае этого года филиал преобразовали в государственный научный центр. Филиал ведёт научно-исследовательскую деятельность по изучению водных биоресурсов и среды их обитания в водных объектах семи субъектов РФ – Астраханской области, Республики Калмыкия, Республики Дагестан и четырёх Северо-Кавказских республиках. Результатом работы филиала является, например, прогноз общих допустимых уловов и рекомендуемого вылова. Это важно для промышленного рыболовства. Возобновление по инициативе рыбохозяйственной науки в 2019 году промысла каспийской кильки добавило к прежним уловам около 30 000 тонн в год. Ежегодно в КаспНИРХ выполняются исследования, связанные с естественным воспроизводством проходных, полупроходных и речных рыб, важные для оценки пополнения промысловых популяций.